| （１） |
日本植生誌全10巻（共著）．至文堂．1980-1989年． |
| （２） |
日本植物群落図説（共著）．至文堂．1990年． |
| （３） |
宮脇 昭・村上雄秀．富士宮市の植生. 177pp．1987年． |
| （４） |
村上雄秀・宮脇 昭. 秩父山地のイヌブナ・ブナ林について．横浜国大環境研紀要，15: 103-117．1988年． |
| （５） |
村上雄秀・宮脇 昭. 秩父山地のヒノキ林について．日生態会誌，40: 85-94．1990年． |
| （６） |
村上雄秀. 南西諸島のマント群落．日生態会誌，41: 191-208．1991年． |
| （７） |
村上雄秀. 秩父山地のウラジロモミ−コメツガ林について．生態環境研究，1: 1-13．1994年． |
| （８） |
MURAKAMI, Y．Heliophilic mantle communities in Japan．Phytocoenologia, 25: 107-152．1995年． |
| （９） |
MURAKAMI, Y., S．MEGURO et al. Woody vegetation in Bintulu and Similajau National Park, Malaysia．ECO-HABITAT, 3: 1-17．1996年． |
| （１０） |
村上雄秀・中村幸人. 丹沢山地における動的・土地的植生について．丹沢大山自然環境総合調査報告書，122-167．1997年． |
| （１１） |
MURAKAMI, Y., Y. NAKAMURA & Y.C. SONG. Scrub and grassland vegetation inrural landscape area of Tiantong National Forest Park, China. ECO-HABITAT |
| （１２） |
村上雄秀. 日本の丘陵地生マント群落. 生態環境研究, 7:25-71. 2000年 |
| （１３） |
村上雄秀. 横浜市内の遊水地の植生概況. 生態環境研究, 8:65-74. 2001年 |
| （１４） |
村上雄秀・中村幸人・鈴木伸一. 高知県大川村の地域植生誌的研究. 生態環境研究, 9:25-84. 2002年． |
| （１５） |
MURAKAMI, Y., Y. NAKAMURA & Y.C. SONG. Mantle communities in eastern China. ECO-HABITAT, 10:123-145. 2003年． |
| （１６） |
坂田正宏・村上雄秀．中小河川中上流域の生態系復元計画．多自然研究，92: 3-11．2003年． |
| （１７） |
村上雄秀・矢ヶ崎朋樹. 横浜市の河川源流域における水辺植生（ ）. 横浜の川と海の生物（河川編）, 127-150. 2004年． |
| （１８） |
村上雄秀. 日本のマント群落の群落体系．生態環境研究, 11:13-48. 2004年． |
| （１９） |
村上雄秀. 丹沢山地におけるシカ食害による偏向遷移について. 日本生態学会関東地区会会報. 54: 7-19. 2005年 |
| （２０） |
村上雄秀. 日本のマント群落の生態的特性．生態環境研究, 12:11-30. 2005年． |
| （２１） |
村上雄秀.日本の路傍・林縁生１年草群落について.生態環境研究,13: 43-58.2006年. |
| （２２） |
村上雄秀・鈴木伸一・林 寿則・矢ヶ崎朋樹.丹沢大山の植生−シカ影響下の植物群落−.丹沢大山総合調査学術報告書,17-66.2007年. |
| （２３） |
安藤彰則・鈴木伸一・村上雄秀.東・西丹沢の植生比較−丹沢東西モニタリングエリアの植生−.丹沢大山総合調査学術報告書,67-74.2007年. |
| （２４） |
村上雄秀.シカ食害下の丹沢山地の植生変遷について.生態環境研究,14: 19-33.2007年. |
| （２５） |
村上雄秀・安藤彰則. 人為的干渉を排除した市街地川辺植生の5年間の遷移.生態環境研究,15: 11-29.2008年 |
| （２６） |
村上雄秀. 植物社会学に関する基本的認識.植生情報,13: 15-18.2009年 |
| （２７） |
村上雄秀・西川博章. 琵琶湖東岸における湖岸および河辺植生の比較研究.生態環境研究,16: 13-52.2009年 |
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